David Phillip Nickerson

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Peter HunterDirector, Auckland Bioengineering Institute, University of AucklandBestätigte E-Mail-Adresse bei auckland.ac.nz
Poul NielsenProfessor, Engineering Science and Auckland Bioengineering Institute, University of AucklandBestätigte E-Mail-Adresse bei auckland.ac.nz
Dagmar WaltemathProfessor of Medical InformaticsBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-greifswald.de
Michael HuckaCalifornia Institute of TechnologyBestätigte E-Mail-Adresse bei caltech.edu
Alan GarnyAuckland Bioengineering Institute, University of AucklandBestätigte E-Mail-Adresse bei auckland.ac.nz
Martin GolebiewskiHITS gGmbH, Heidelberg (Germany)Bestätigte E-Mail-Adresse bei h-its.org
Jonathan CooperUniversity College LondonBestätigte E-Mail-Adresse bei ucl.ac.uk
Frank T. BergmannBioQUANT/COS, Heidelberg University, Heidelberg, GermanyBestätigte E-Mail-Adresse bei caltech.edu
Falk SchreiberProfessor, University of Konstanz and Monash UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-konstanz.de
Herbert M SauroUniversity of WashingtonBestätigte E-Mail-Adresse bei u.washington.edu
Chris MyersUniversity of UtahBestätigte E-Mail-Adresse bei ece.utah.edu
Koray AtalagAuckland Bioengineering Institute, University of AucklandBestätigte E-Mail-Adresse bei auckland.ac.nz
Martyn NashProfessor of Biomedical Engineering, University of Auckland.Bestätigte E-Mail-Adresse bei auckland.ac.nz
Edmund J. CrampinProfessor, University of Melbourne, AustraliaBestätigte E-Mail-Adresse bei unimelb.edu.au
Brett G. OlivierVU AmsterdamBestätigte E-Mail-Adresse bei vu.nl
Nicolas SmithQueensland University of TechnologyBestätigte E-Mail-Adresse bei qut.edu.au
Dr. Matthias KönigHumboldt-University BerlinBestätigte E-Mail-Adresse bei hu-berlin.de
Martin BuistDepartment of Bioengineering, National University of SingaporeBestätigte E-Mail-Adresse bei nus.edu.sg
Sarah KeatingUCLBestätigte E-Mail-Adresse bei ucl.ac.uk
Padraig GleesonDepartment of Neuroscience, Physiology and Pharmacology, University College LondonBestätigte E-Mail-Adresse bei ucl.ac.uk

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An overview of CellML 1.1, a biological model description language AA Cuellar, CM Lloyd, PF Nielsen, DP Bullivant, DP Nickerson, PJ Hunter Simulation 79 (12), 740-747, 2003	395	2003
Reproducible computational biology experiments with SED-ML-the simulation experiment description markup language D Waltemath, R Adams, FT Bergmann, M Hucka, F Kolpakov, AK Miller, ... BMC systems biology 5 (1), 1-10, 2011	275	2011
CellML and associated tools and techniques A Garny, DP Nickerson, J Cooper, RW Santos, AK Miller, S McKeever, ... Philosophical transactions of the Royal Society A: Mathematical, physical …, 2008	169	2008
The physiome model repository 2 T Yu, CM Lloyd, DP Nickerson, MT Cooling, AK Miller, A Garny, ... Bioinformatics 27 (5), 743-744, 2011	161	2011
Multiscale computational modelling of the heart NP Smith, DP Nickerson, EJ Crampin, PJ Hunter Acta Numerica 13, 371-431, 2004	154	2004
Minimum information about a simulation experiment (MIASE) D Waltemath, R Adams, DA Beard, FT Bergmann, US Bhalla, R Britten, ... PLoS computational biology 7 (4), e1001122, 2011	148	2011
OpenCMISS: a multi-physics & multi-scale computational infrastructure for the VPH/Physiome project C Bradley, A Bowery, R Britten, V Budelmann, O Camara, R Christie, ... Progress in biophysics and molecular biology 107 (1), 32-47, 2011	146	2011
COMBINE archive and OMEX format: one file to share all information to reproduce a modeling project FT Bergmann, R Adams, S Moodie, J Cooper, M Glont, M Golebiewski, ... BMC bioinformatics 15 (1), 1-9, 2014	133	2014
New developments in a strongly coupled cardiac electromechanical model D Nickerson, N Smith, P Hunter EP Europace 7 (s2), S118-S127, 2005	112	2005
An overview of the CellML API and its implementation AK Miller, J Marsh, A Reeve, A Garny, R Britten, M Halstead, J Cooper, ... BMC bioinformatics 11 (1), 1-12, 2010	91	2010
CellML metadata standards, associated tools and repositories DA Beard, R Britten, MT Cooling, A Garny, MDB Halstead, PJ Hunter, ... Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical …, 2009	87	2009
Mathematical modelling of the heart: cell to organ NP Smith, PJ Mulquiney, MP Nash, CP Bradley, DP Nickerson, PJ Hunter Chaos, Solitons & Fractals 13 (8), 1613-1621, 2002	79	2002
A model of cardiac cellular electromechanics DP Nickerson, NP Smith, PJ Hunter Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series A …, 2001	78	2001
Promoting coordinated development of community-based information standards for modeling in biology: the COMBINE initiative M Hucka, DP Nickerson, GD Bader, FT Bergmann, J Cooper, E Demir, ... Frontiers in bioengineering and biotechnology 3, 19, 2015	75	2015
Modelling the passive and nerve activated response of the rectus femoris muscle to a flexion loading: a finite element framework JW Fernandez, ML Buist, DP Nickerson, PJ Hunter Medical engineering & physics 27 (10), 862-870, 2005	62	2005
Community-driven roadmap for integrated disease maps M Ostaszewski, S Gebel, I Kuperstein, A Mazein, A Zinovyev, U Dogrusoz, ... Briefings in bioinformatics 20 (2), 659-670, 2019	55	2019
Harmonizing semantic annotations for computational models in biology ML Neal, M König, D Nickerson, G Mısırlı, R Kalbasi, A Dräger, K Atalag, ... Briefings in bioinformatics 20 (2), 540-550, 2019	52	2019
Computational multiscale modeling in the IUPS physiome project: modeling cardiac electromechanics D Nickerson, M Nash, P Nielsen, N Smith, P Hunter IBM Journal of Research and Development 50 (6), 617-630, 2006	50	2006
The Noble cardiac ventricular electrophysiology models in CellML DP Nickerson, PJ Hunter Progress in biophysics and molecular biology 90 (1-3), 346-359, 2006	38	2006
The CellML 1.1 specification A Cuellar, W Hedley, M Nelson, C Lloyd, M Halstead, D Bullivant, ... Journal of Integrative Bioinformatics 12 (2), 4-85, 2015	36	2015

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