Gerrit Groenhof

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Helmut GrubmullerTheoretical and Computational Biophysics Department, Max Planck Institute for Biophysical ChemistryBestätigte E-Mail-Adresse bei gwdg.de
Berk HessKTH Royal Institute of Technology, Stockholm, Sweden; Science for Life Laboratory, Stockholm, SwedenBestätigte E-Mail-Adresse bei scilifelab.se
Alan E. MarkProfessor of Biophysical Chemistry, University of QueenslandBestätigte E-Mail-Adresse bei uq.edu.au
David van der SpoelProfessor of Biology, Uppsala UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei xray.bmc.uu.se
Mike RobbChemistry Department Imperial CollegeBestätigte E-Mail-Adresse bei imperial.ac.uk
Erik LindahlProfessor of Biophysics, Stockholm University & KTH, Science for Life LaboratoryBestätigte E-Mail-Adresse bei dbb.su.se
Lars SchäferProfessor, Ruhr University BochumBestätigte E-Mail-Adresse bei ruhr-uni-bochum.de
Dmitry MorozovUniversity of Jyväskylä, Chemistry Department, Nanoscience centreBestätigte E-Mail-Adresse bei jyu.fi
Jussi ToppariAssociate Professor, University of JyväskyläBestätigte E-Mail-Adresse bei jyu.fi
Ludger InhesterCenter for Free-Electron Laser Science, DESYBestätigte E-Mail-Adresse bei desy.de
Richard NeutzeProfessor of Biochemistry, University of GothenburgBestätigte E-Mail-Adresse bei gu.se
Gergely KatonaFull Professor, University of GothenburgBestätigte E-Mail-Adresse bei gu.se
Erik MalmerbergAstraZenecaBestätigte E-Mail-Adresse bei astrazeneca.com
Marc F. LensinkUniversity of Lille, CNRS UMR8576 UGSFBestätigte E-Mail-Adresse bei univ-lille1.fr
Jochen S HubProfessor of Computational Biophysics, Saarland UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-saarland.de
marco cammarataCNRS researcher, University of Rennes & Beamline scientist at ESRFBestätigte E-Mail-Adresse bei esrf.eu
Bert L. de GrootMax Planck Institute for biophysical chemistryBestätigte E-Mail-Adresse bei gwdg.de
Sam de VisserUniversity of ManchesterBestätigte E-Mail-Adresse bei manchester.ac.uk
Linda JohanssonAssistant professor at Sahlgrenska Academy, University of GothenburgBestätigte E-Mail-Adresse bei gu.se
Xi ChenAcademy Research fellow, Aalto UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei aalto.fi

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Gerrit Groenhof

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GROMACS: fast, flexible, and free D Van Der Spoel, E Lindahl, B Hess, G Groenhof, AE Mark, ... Journal of computational chemistry 26 (16), 1701-1718, 2005	13341	2005
Femtosecond structural dynamics drives the trans/cis isomerization in photoactive yellow protein K Pande, CDM Hutchison, G Groenhof, A Aquila, JS Robinson, J Tenboer, ... Science 352 (6286), 725-729, 2016	353	2016
g_membed: Efficient insertion of a membrane protein into an equilibrated lipid bilayer with minimal perturbation MG Wolf, M Hoefling, C Aponte‐Santamaría, H Grubmüller, G Groenhof Journal of computational chemistry 31 (11), 2169-2174, 2010	344	2010
Photoactivation of the photoactive yellow protein: why photon absorption triggers a trans-to-cis isomerization of the chromophore in the protein G Groenhof, M Bouxin-Cademartory, B Hess, SP De Visser, ... Journal of the American Chemical Society 126 (13), 4228-4233, 2004	297	2004
Visualizing a protein quake with time-resolved X-ray scattering at a free-electron laser D Arnlund, LC Johansson, C Wickstrand, A Barty, GJ Williams, ... Nature methods 11 (9), 923-926, 2014	180	2014
Quantifying artifacts in Ewald simulations of inhomogeneous systems with a net charge JS Hub, BL de Groot, H Grubmüller, G Groenhof Journal of chemical theory and computation 10 (1), 381-390, 2014	175	2014
Ultrafast deactivation of an excited cytosine− guanine base pair in DNA G Groenhof, LV Schäfer, M Boggio-Pasqua, M Goette, H Grubmüller, ... Journal of the American Chemical Society 129 (21), 6812-6819, 2007	173	2007
Constant pH molecular dynamics in explicit solvent with λ-dynamics S Donnini, F Tegeler, G Groenhof, H Grubmüller Journal of chemical theory and computation 7 (6), 1962-1978, 2011	171	2011
Ultrafast deactivation channel for thymine dimerization M Boggio-Pasqua, G Groenhof, LV Schäfer, H Grubmüller, MA Robb Journal of the American Chemical Society 129 (36), 10996-10997, 2007	145	2007
Photoswitching of the fluorescent protein asFP595: mechanism, proton pathways, and absorption spectra LV Schäfer, G Groenhof, AR Klingen, GM Ullmann, M Boggio‐Pasqua, ... Angewandte Chemie International Edition 46 (4), 530-536, 2007	129	2007
Introduction to QM/MM simulations G Groenhof Biomolecular Simulations, 43-66, 2013	111	2013
Light-induced structural changes in a photosynthetic reaction center caught by Laue diffraction AB Wöhri, G Katona, LC Johansson, E Fritz, E Malmerberg, M Andersson, ... science 328 (5978), 630-633, 2010	111	2010
Chromophore protonation state controls photoswitching of the fluoroprotein asFP595 LV Schäfer, G Groenhof, M Boggio-Pasqua, MA Robb, H Grubmüller PLoS computational biology 4 (3), e1000034, 2008	111	2008
Multiscale molecular dynamics simulations of polaritonic chemistry HL Luk, J Feist, JJ Toppari, G Groenhof Journal of chemical theory and computation 13 (9), 4324-4335, 2017	101	2017
Arginine52 controls the photoisomerization process in photoactive yellow protein G Groenhof, LV Schäfer, M Boggio-Pasqua, H Grubmüller, MA Robb Journal of the American Chemical Society 130 (11), 3250-3251, 2008	97	2008
Hydrogen bonding controls excited-state decay of the photoactive yellow protein chromophore M Boggio-Pasqua, MA Robb, G Groenhof Journal of the American Chemical Society 131 (38), 13580-13581, 2009	90	2009
GROMACS: fast, flexible, and free HJC Berendsen, B Hess, E Lindahl, D Van Der Spoel, AE Mark, ... J. Comput. Chem 26 (16), 1701-1718, 2005	87	2005
Molecular basis of the light-driven switching of the photochromic fluorescent protein Padron T Brakemann, G Weber, M Andresen, G Groenhof, AC Stiel, S Trowitzsch, ... Journal of Biological Chemistry 285 (19), 14603-14609, 2010	82	2010
Signal transduction in the photoactive yellow protein. I. Photon absorption and the isomerization of the chromophore G Groenhof, MF Lensink, HJC Berendsen, JG Snijders, AE Mark Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 48 (2), 202-211, 2002	82	2002
Tracking polariton relaxation with multiscale molecular dynamics simulations G Groenhof, C Climent, J Feist, D Morozov, JJ Toppari The journal of physical chemistry letters 10 (18), 5476-5483, 2019	73	2019

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