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Koautoren

Mario StankeProfessor of Bioinformatics, University of GreifswaldBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-greifswald.de
Mark BorodovskyRegents' Professor, Georgia TechBestätigte E-Mail-Adresse bei gatech.edu
Thomas LingnerDepartment of Bioinformatics, University of GoettingenBestätigte E-Mail-Adresse bei gobics.de
Peter MeinickeSenior Scientist, University of GoettingenBestätigte E-Mail-Adresse bei gwdg.de
Alex LomsadzeSenior Research Scientist, The Wallace H. Coulter Department of Biomedical Engineering at GeorgiaBestätigte E-Mail-Adresse bei gatech.edu
Rolf DanielProfessor of Genomic and Applied Microbiology, Georg-August University GöttingenBestätigte E-Mail-Adresse bei gwdg.de
Burkhard MorgensternProfessor of Bioinformatics, University of GöttingenBestätigte E-Mail-Adresse bei gwdg.de
Tonatiuh Peña CentenoGerman Center for Neurodegenerative DiseasesBestätigte E-Mail-Adresse bei dzne.de
Braus, GerhardProfessor for Microbiology and Genetics, University of GoettingenBestätigte E-Mail-Adresse bei gwdg.de
Dr. Harald KuschPostdoc, University Medical Center GöttingenBestätigte E-Mail-Adresse bei med.uni-goettingen.de
Van-Tuan TranDr. rer. nat, University of Science, Vietnam National University, HanoiBestätigte E-Mail-Adresse bei vnu.edu.vn
Hervé PhilippeUniversité de MontréalBestätigte E-Mail-Adresse bei umontreal.ca
Philipp SchifferGroup Leader, The Worm Lab, University of CologneBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-koeln.de
Telford MJUniversity College LondonBestätigte E-Mail-Adresse bei ucl.ac.uk
Josep F AbrilAssociate Professor; Dep Genetics, Microbiology & Statistics; Universitat de BarcelonaBestätigte E-Mail-Adresse bei ub.edu
Brenda GavilánBestätigte E-Mail-Adresse bei ub.edu
Pedro Martinez-SerraDepartament Genetica, Universitat BarcelonaBestätigte E-Mail-Adresse bei ub.edu

Katharina Hoff

Universität Greifswald

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Bioinformatics Gene Prediction Metagenomics Genome Annotation


Titel Nach Zitationen sortieren Nach Jahr sortieren Nach Titel sortieren	Zitiert von Zitiert von	Jahr
Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimicry adaptations among species KK Dasmahapatra, JR Walters, AD Briscoe, JW Davey, A Whibley, ... Nature 487, 94-98, 2012	860	2012
BRAKER1: unsupervised RNA-Seq-based genome annotation with GeneMark-ET and AUGUSTUS KJ Hoff, S Lange, A Lomsadze, M Borodovsky, M Stanke Bioinformatics 32 (5), 767-769, 2016	394	2016
Finding the missing honey bee genes: lessons learned from a genome upgrade CG Elsik, KC Worley, AK Bennett, M Beye, F Camara, CP Childers, ... BMC genomics 15 (1), 86, 2014	285	2014
The genomes of two key bumblebee species with primitive eusocial organization BM Sadd, SM Barribeau, G Bloch, DC De Graaf, P Dearden, CG Elsik, ... Genome biology 16 (1), 1-32, 2015	218	2015
WebAUGUSTUS—a web service for training AUGUSTUS and predicting genes in eukaryotes KJ Hoff, M Stanke Nucleic acids research 41 (W1), W123-W128, 2013	157	2013
Orphelia: predicting genes in metagenomic sequencing reads KJ Hoff, T Lingner, P Meinicke, M Tech Nucleic acids research 37 (suppl_2), W101-W105, 2009	134	2009
Gene prediction in metagenomic fragments: a large scale machine learning approach KJ Hoff, M Tech, T Lingner, R Daniel, B Morgenstern, P Meinicke BMC bioinformatics 9 (1), 217, 2008	115	2008
The effect of sequencing errors on metagenomic gene prediction KJ Hoff BMC genomics 10 (1), 520, 2009	114	2009
Verticillium transcription activator of adhesion Vta2 suppresses microsclerotia formation and is required for systemic infection of plant roots VT Tran, SA Braus‐Stromeyer, H Kusch, M Reusche, A Kaever, A Kühn, ... New Phytologist 202 (2), 565-581, 2014	70	2014
Whole-Genome Annotation with BRAKER KJ Hoff, A Lomsadze, M Borodovsky, M Stanke Methods in Molecular Biology 1962, 65-95, 2019	38	2019
Mitigating Anticipated Effects of Systematic Errors Supports Sister-Group Relationship between Xenacoelomorpha and Ambulacraria H Philippe, AJ Poustka, M Chiodin, KJ Hoff, C Dessimoz, B Tomiczek, ... Current Biology, 2019	30	2019
Predicting genes in single genomes with augustus KJ Hoff, M Stanke Current protocols in bioinformatics 65 (1), e57, 2019	29	2019
The nervous system of Xenacoelomorpha: a genomic perspective E Perea-Atienza, B Gavilán, M Chiodin, JF Abril, KJ Hoff, AJ Poustka, ... Journal of Experimental Biology 218 (4), 618-628, 2015	29	2015
Current methods for automated annotation of protein-coding genes KJ Hoff, M Stanke Current Opinion in insect science 7, 8-14, 2015	19	2015
MakeHub: Fully automated generation of UCSC genome browser assembly hubs KJ Hoff Genomics, proteomics & bioinformatics 17 (5), 546-549, 2019	3	2019
VARUS: Sampling Complementary RNA Reads from the Sequence Read Archive M Stanke, W Bruhn, F Becker, KJ Hoff BMC Bioinformatics 20 (558), https://doi.org/10.1101/608737, 2019	3	2019
BRAKER2: incorporating protein homology information into gene prediction with GeneMark-EP and AUGUSTUS KJ Hoff, A Lomsadze, M Stanke, M Borodovsky Plant and Animal Genomes XXVI, 2018	3	2018
Basic statistics KJ Hoff	3	2010
Gene prediction in metagenomic sequencing reads KJ Hoff Niedersächsische Staats-und Universitätsbibliothek Göttingen, 2009	3	2009
Non-invasive and label-free 3D-visualization shows in vivo oligomerization of the staphylococcal alkaline shock protein 23 (Asp23) I Petersen, R Schlüter, KJ Hoff, V Liebscher, G Bange, K Riedel, ... Scientific reports 10 (1), 1-7, 2020	2	2020

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