Michael T. Wolfinger

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Ivo HofackerUniversity of ViennaBestätigte E-Mail-Adresse bei tbi.univie.ac.at
Peter F StadlerProfessor of Bioinformatics, Univ. LeipzigBestätigte E-Mail-Adresse bei bioinf.uni-leipzig.de
Christoph FlammAssociate Professor, Department of Theoretical Chemistry, University of ViennaBestätigte E-Mail-Adresse bei univie.ac.at
Udo BläsiProfessor of Molecular MicrobiologyBestätigte E-Mail-Adresse bei univie.ac.at
Ronny LorenzBestätigte E-Mail-Adresse bei tbi.univie.ac.at
Muralidhar TataUniversity of Texas Health Science CenterBestätigte E-Mail-Adresse bei uth.tmc.edu
Gerik ScheuermannProfessor für Informatik, Universität LeipzigBestätigte E-Mail-Adresse bei informatik.uni-leipzig.de
Sebastian WillResearcher, Bioinformatics, TBI, University of ViennaBestätigte E-Mail-Adresse bei tbi.univie.ac.at
Martin MiddendorfUniversity of LeipzigBestätigte E-Mail-Adresse bei informatik.uni-leipzig.de
Florian EggenhoferBioinformatics Group, Department of Computer Science, Albert-Ludwigs-University FreiburgBestätigte E-Mail-Adresse bei informatik.uni-freiburg.de
Adriano de Bernardi SchneiderUniversity of California, San DiegoBestätigte E-Mail-Adresse bei ucsd.edu
Christian HeineLeipzig University, GermanyBestätigte E-Mail-Adresse bei informatik.uni-leipzig.de
Konstantin ByrgazovOncopeptides ABBestätigte E-Mail-Adresse bei oncopeptides.com
Anna SkuchaPhD Student, CeMM - Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of SciencesBestätigte E-Mail-Adresse bei cemm.oeaw.ac.at
Sebastien CampagnePost doctoral researcherBestätigte E-Mail-Adresse bei mol.biol.ethz.ch
Frederic AllainProfessor of BioNMRBestätigte E-Mail-Adresse bei mol.biol.ethz.ch
Jörg FallmannBioinformatics, University of LeipzigBestätigte E-Mail-Adresse bei bioinf.uni-leipzig.de
Andreas DötschScientist, Max Rubner-InstituteBestätigte E-Mail-Adresse bei mri.bund.de
Martin Raden, nee MannFreiburg UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei informatik.uni-freiburg.de
Michael F. JantschMedical University of Vienna, Division of Cell- and Developmental BiologyBestätigte E-Mail-Adresse bei muv.ac.at

Michael T. Wolfinger

Department of Theoretical Chemistry, University of Vienna

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Barrier trees of degenerate landscapes C Flamm, IL Hofacker, PF Stadler, MT Wolfinger Zeitschrift für Physikalische Chemie 216 (2), 155, 2002	215	2002
Efficient computation of RNA folding dynamics MT Wolfinger, WA Svrcek-Seiler, C Flamm, IL Hofacker, PF Stadler Journal of Physics A: Mathematical and General 37 (17), 4731, 2004	154*	2004
Folding kinetics of large RNAs M Geis, C Flamm, MT Wolfinger, A Tanzer, IL Hofacker, M Middendorf, ... Journal of Molecular Biology 379 (1), 160-173, 2008	91	2008
Predicting RNA secondary structures from sequence and probing data R Lorenz, MT Wolfinger, A Tanzer, IL Hofacker Methods 103, 86-98, 2016	75	2016
SHAPE directed RNA folding R Lorenz, D Luntzer, IL Hofacker, PF Stadler, MT Wolfinger Bioinformatics 32 (1), 145-147, 2016	75	2016
TSSAR: TSS annotation regime for dRNA-seq data F Amman, MT Wolfinger, R Lorenz, IL Hofacker, PF Stadler, S Findeiß BMC Bioinformatics 15 (1), 1-11, 2014	55	2014
BarMap: RNA folding on dynamic energy landscapes IL Hofacker, C Flamm, C Heine, MT Wolfinger, G Scheuermann, ... RNA 16 (7), 1308-1316, 2010	53	2010
The MazF-regulon: a toolbox for the post-transcriptional stress response in Escherichia coli M Sauert, MT Wolfinger, O Vesper, C Müller, K Byrgazov, I Moll Nucleic acids research 44 (14), 6660-6675, 2016	43	2016
Differential transcriptional responses to Ebola and Marburg virus infection in bat and human cells M Hölzer, V Krähling, F Amman, E Barth, SH Bernhart, VAO Carmelo, ... Scientific Reports 6 (1), 1-17, 2016	41	2016
General and microRNA-mediated mRNA degradation occurs on ribosome complexes in Drosophila cells S Antic, MT Wolfinger, A Skucha, S Hosiner, S Dorner Molecular and Cellular Biology 35 (13), 2309-2320, 2015	34	2015
Interplay between the catabolite repression control protein Crc, Hfq and RNA in Hfq-dependent translational regulation in Pseudomonas aeruginosa E Sonnleitner, A Wulf, S Campagne, XY Pei, MT Wolfinger, G Forlani, ... Nucleic acids research 46 (3), 1470-1485, 2018	33	2018
ViennaNGS: A toolbox for building efficient next-generation sequencing analysis pipelines MT Wolfinger, J Fallmann, F Eggenhofer, F Amman F1000Research 4, 2015	32	2015
RNA_Seq Based Transcriptional Profiling of Pseudomonas aeruginosa PA14 after Short- and Long-Term Anoxic Cultivation in Synthetic Cystic Fibrosis Sputum … M Tata, MT Wolfinger, F Amman, N Roschanski, A Dötsch, E Sonnleitner, ... PLoS One 11 (1), e0147811, 2016	31	2016
Exploring the lower part of discrete polymer model energy landscapes MT Wolfinger, S Will, IL Hofacker, R Backofen, PF Stadler EPL (Europhysics Letters) 74 (4), 726, 2006	28	2006
NMR structural profiling of transcriptional intermediates reveals riboswitch regulation by metastable RNA conformations C Helmling, A Wacker, MT Wolfinger, IL Hofacker, M Hengesbach, ... Journal of the American Chemical Society 139 (7), 2647-2656, 2017	25	2017
Cross-regulation by CrcZ RNA controls anoxic biofilm formation in Pseudomonas aeruginosa P Pusic, M Tata, MT Wolfinger, E Sonnleitner, S Häussler, U Bläsi Scientific Reports 6 (1), 1-8, 2016	21	2016
Functional RNA structures in the 3′ UTR of tick-borne, insect-specific and no-known-vector flaviviruses R Ochsenreiter, IL Hofacker, MT Wolfinger Viruses 11 (3), 298, 2019	20	2019
The SmAP1/2 proteins of the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus interact with the exosome and stimulate A-rich tailing of transcripts B Märtens, L Hou, F Amman, MT Wolfinger, E Evguenieva-Hackenberg, ... Nucleic acids research 45 (13), 7938-7949, 2017	17	2017
The energy landscape of RNA folding MT Wolfinger Institute for Theoretical Chemistry, University of Vienna, 2001	15	2001
Genomic epidemiology of superspreading events in Austria reveals mutational dynamics and transmission properties of SARS-CoV-2 A Popa, JW Genger, MD Nicholson, T Penz, D Schmid, SW Aberle, ... Science Translational Medicine 12 (573), 2020	13*	2020

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