Michael T. Wolfinger

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Ivo HofackerUniversity of ViennaBestätigte E-Mail-Adresse bei tbi.univie.ac.at
Peter F StadlerProfessor of Bioinformatics, Univ. LeipzigBestätigte E-Mail-Adresse bei bioinf.uni-leipzig.de
Christoph FlammAssociate Professor, Department of Theoretical Chemistry, University of ViennaBestätigte E-Mail-Adresse bei univie.ac.at
Udo BläsiProfessor of Molecular MicrobiologyBestätigte E-Mail-Adresse bei univie.ac.at
Fabian AmmanCeMMBestätigte E-Mail-Adresse bei meduniwien.ac.at
Ronny LorenzBestätigte E-Mail-Adresse bei tbi.univie.ac.at
Roman OchsenreiterUniversity of ViennaBestätigte E-Mail-Adresse bei tbi.univie.ac.at
Adriano de Bernardi SchneiderUniversity of California, Santa CruzBestätigte E-Mail-Adresse bei ucsc.edu
Muralidhar TataAir ProteinBestätigte E-Mail-Adresse bei airprotein.com
Trushar R Patel, PhD, DScAssociate Dean, Associate Professor and Canada Research Chair, University of LethbridgeBestätigte E-Mail-Adresse bei uleth.ca
Maria WaldlDepartment of Theoretical Chemistry, University of ViennaBestätigte E-Mail-Adresse bei viennarna.at
Tyler MrozowichMassachusetts General Hospital, Harvard Medical SchoolBestätigte E-Mail-Adresse bei molbio.mgh.harvard.edu
Sebastian WillProfessor of Bioinformatics, LIX, Ecole PolytechniqueBestätigte E-Mail-Adresse bei polytechnique.edu
Gerik ScheuermannProfessor für Informatik, Universität LeipzigBestätigte E-Mail-Adresse bei informatik.uni-leipzig.de
Andreas DötschScientist, Max Rubner-InstituteBestätigte E-Mail-Adresse bei mri.bund.de
Martin MiddendorfProfessor of Swarm Intelligence and Complex Systems, University of LeipzigBestätigte E-Mail-Adresse bei informatik.uni-leipzig.de
Stefan BadeltInstitute for Theoretical Chemistry, University of ViennaBestätigte E-Mail-Adresse bei tbi.univie.ac.at
Florian EggenhoferBioinformatics Group, Department of Computer Science, Albert-Ludwigs-University FreiburgBestätigte E-Mail-Adresse bei informatik.uni-freiburg.de
Frederic AllainProfessor of BioNMRBestätigte E-Mail-Adresse bei mol.biol.ethz.ch
Sebastien CampagneINSERM CRCN, Universite de BordeauxBestätigte E-Mail-Adresse bei inserm.fr

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Michael T. Wolfinger

Principal Investigator at University of Vienna / Founder & CEO at RNAForecast

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Barrier trees of degenerate landscapes C Flamm, IL Hofacker, PF Stadler, MT Wolfinger Zeitschrift für Physikalische Chemie 216 (2), 155, 2002	243	2002
Genomic epidemiology of superspreading events in Austria reveals mutational dynamics and transmission properties of SARS-CoV-2 A Popa, JW Genger, MD Nicholson, T Penz, D Schmid, SW Aberle, ... Science Translational Medicine 12 (573), 2020	231	2020
Efficient computation of RNA folding dynamics MT Wolfinger, WA Svrcek-Seiler, C Flamm, IL Hofacker, PF Stadler Journal of Physics A: Mathematical and General 37 (17), 4731, 2004	135	2004
Predicting RNA secondary structures from sequence and probing data R Lorenz, MT Wolfinger, A Tanzer, IL Hofacker Methods 103, 86-98, 2016	124	2016
SHAPE directed RNA folding R Lorenz, D Luntzer, IL Hofacker, PF Stadler, MT Wolfinger Bioinformatics 32 (1), 145-147, 2016	114	2016
Folding kinetics of large RNAs M Geis, C Flamm, MT Wolfinger, A Tanzer, IL Hofacker, M Middendorf, ... Journal of Molecular Biology 379 (1), 160-173, 2008	108	2008
Interplay between the catabolite repression control protein Crc, Hfq and RNA in Hfq-dependent translational regulation in Pseudomonas aeruginosa E Sonnleitner, A Wulf, S Campagne, XY Pei, MT Wolfinger, G Forlani, ... Nucleic acids research 46 (3), 1470-1485, 2018	84	2018
Differential transcriptional responses to Ebola and Marburg virus infection in bat and human cells M Hölzer, V Krähling, F Amman, E Barth, SH Bernhart, VAO Carmelo, ... Scientific Reports 6 (1), 1-17, 2016	68	2016
TSSAR: TSS annotation regime for dRNA-seq data F Amman, MT Wolfinger, R Lorenz, IL Hofacker, PF Stadler, S Findeiß BMC Bioinformatics 15 (1), 1-11, 2014	66	2014
BarMap: RNA folding on dynamic energy landscapes IL Hofacker, C Flamm, C Heine, MT Wolfinger, G Scheuermann, ... RNA 16 (7), 1308-1316, 2010	60	2010
Functional RNA structures in the 3′ UTR of tick-borne, insect-specific and no-known-vector flaviviruses R Ochsenreiter, IL Hofacker, MT Wolfinger Viruses 11 (3), 298, 2019	58	2019
The MazF-regulon: a toolbox for the post-transcriptional stress response in Escherichia coli M Sauert, MT Wolfinger, O Vesper, C Müller, K Byrgazov, I Moll Nucleic Acids Research 44 (14), 6660-6675, 2016	58	2016
NMR structural profiling of transcriptional intermediates reveals riboswitch regulation by metastable RNA conformations C Helmling, A Wacker, MT Wolfinger, IL Hofacker, M Hengesbach, ... Journal of the American Chemical Society 139 (7), 2647-2656, 2017	53	2017
RNA_Seq Based Transcriptional Profiling of Pseudomonas aeruginosa PA14 after Short- and Long-Term Anoxic Cultivation in Synthetic Cystic Fibrosis Sputum … M Tata, MT Wolfinger, F Amman, N Roschanski, A Dötsch, E Sonnleitner, ... PLoS One 11 (1), e0147811, 2016	50	2016
General and microRNA-mediated mRNA degradation occurs on ribosome complexes in Drosophila cells S Antic, MT Wolfinger, A Skucha, S Hosiner, S Dorner Molecular and Cellular Biology 35 (13), 2309-2320, 2015	48	2015
Updated phylogeny of chikungunya virus suggests lineage-specific RNA architecture A de Bernardi Schneider, R Ochsenreiter, R Hostager, IL Hofacker, ... Viruses 11 (9), 798, 2019	47	2019
Exact folding dynamics of RNA secondary structures MT Wolfinger, WA Svrcek-Seiler, C Flamm, IL Hofacker, PF Stadler J. Phys. A: Math 37, 4731-4741, 2004	45	2004
Cross-regulation by CrcZ RNA controls anoxic biofilm formation in Pseudomonas aeruginosa P Pusic, M Tata, MT Wolfinger, E Sonnleitner, S Häussler, U Bläsi Scientific Reports 6 (1), 1-8, 2016	43	2016
ViennaNGS: A toolbox for building efficient next-generation sequencing analysis pipelines MT Wolfinger, J Fallmann, F Eggenhofer, F Amman F1000Research 4, 2015	38	2015
Exploring the lower part of discrete polymer model energy landscapes MT Wolfinger, S Will, IL Hofacker, R Backofen, PF Stadler Europhysics Letters 74 (4), 726, 2006	31	2006

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